14-10-2023
Пирролизин — это природная аминокислота, кодируемая генами некоторых метаногенных архей. Пирролизин входит в состав некоторых ферментов метаболизма метана.
Пирролизин является производным аминокислоты лизина и кодируется кодоном UAG
(обычно 'amber' стоп-кодоном). Возможно, модифицируется в случае наличия специфической последовательности нуклеотидов PYLIS, которая образует стебелек и петлю в структуре мРНК, усиливая включение пирролизина вместо терминации трансляции. Кодон UAG
используется реже, чем другие стоп-кодоны, и, если встречается в открытой рамке считывания, за ним, как правило, следуют другие стоп-кодоны.
Рядом с кластером генов переноса метильной группы археи Methanosarcina barkeri располагается ген pylT, который кодирует необычную тРНК с антикодоном CUA
. Соседний ген pylS кодирует аминоацил-тРНК-синтетазу второго класса, которая присоединяет пирролизин к тРНК-продукту гена pylT. Оперон, содержащий гены pylT и pylS также найден в геномах других секвенированных представителей семейства Methanosarcinaceae. Гомологи генов pylS и pylT обнаружены также в грам-положительной бактерии Desulfitobacterium hafniense, хотя функции этих гомологов у данной бактерии неизвестны.[1]
Первоначально было показано, что продукт гена pylT — тРНК с антикодоном (CUA), может быть «заряжена» аминокислотой лизином с помощью белка PylS. Относительно недавно было показано, что тРНК с аниткодоном CUA
может быть «заряжена» лизином в условиях in vitro последовательным взаимодействием с лизиновыми тРНК-синтетазами первого и второго класса из M. barkeri. Последние данные указывают на то, что происходит прямое присоединение пирролизина к тРНК с антикодоном CUA при помощи белкового продукта гена pylS. Это означает, что пирролизин представляет собой 22ую аминокислоту, закодированную генетически.[2]
Для обозначения пирролизина ИЮПАК рекомендует трехбуквенное сокращение Pyl и однобуквенное O.
Аминокислоты | |
---|---|
Стандартные аминокислоты | Аланин · Аргинин · Аспарагин · Аспарагиновая кислота · Валин · Гистидин · Глицин · Глутамин · Глутаминовая кислота · Изолейцин · Лейцин · Лизин · Метионин · Пролин · Серин · Тирозин · Треонин · Триптофан · Фенилаланин · Цистеин |
Нестандартные аминокислоты | Пирролизин · Селеноцистеин |
|
Это заготовка статьи по биохимии. Вы можете помочь проекту, исправив и дополнив её. |
Пирролизин.